Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MED16Q9Y2X0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms