Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms