Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms