Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms