Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms