Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf109Q9NX04 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf109Q9NX04 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms