Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms