Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms