Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHD1Q9BUP0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms