Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAT1Q99536 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms