Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAC3Q96MF2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms