Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ1Q96JM4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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