Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITCHQ96J02 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms