Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms