Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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