Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA2D4Q7Z3S7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms