Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTOP1Q7RTM1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms