Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms