Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC141Q6ZP82 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms