Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms