Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms