Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms