Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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