Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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