Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITSN1Q15811 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITSN1Q15811 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms