Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
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NCOA1Q15788 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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NCOA1Q15788 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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NCOA1Q15788 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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NCOA1Q15788 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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NCOA1Q15788 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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