Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
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