Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
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ITGB3BPQ13352 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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