Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP140Q13342 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SP140Q13342 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SP140Q13342 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP140Q13342 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SP140Q13342 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SP140Q13342 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SP140Q13342 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP140Q13342 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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