Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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