Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
STX4Q12846 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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STX4Q12846 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
STX4Q12846 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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