Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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EFEMP1Q12805 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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EFEMP1Q12805 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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EFEMP1Q12805 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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