Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms