Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms