Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms