Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO4P61968 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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LMO4P61968 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO4P61968 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO4P61968 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO4P61968 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO4P61968 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO4P61968 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO4P61968 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO4P61968 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO4P61968 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO4P61968 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO4P61968 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO4P61968 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO4P61968 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO4P61968 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO4P61968 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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