Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms