Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5CP41229 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5CP41229 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms