Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms