Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP214P35658 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP214P35658 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP214P35658 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP214P35658 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP214P35658 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP214P35658 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP214P35658 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP214P35658 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP214P35658 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP214P35658 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms