Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP1P29466 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASP1P29466 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASP1P29466 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASP1P29466 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASP1P29466 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASP1P29466 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms