Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CA4P22748 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CA4P22748 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CA4P22748 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CA4P22748 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CA4P22748 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CA4P22748 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CA4P22748 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CA4P22748 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CA4P22748 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CA4P22748 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CA4P22748 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CA4P22748 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CA4P22748 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CA4P22748 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CA4P22748 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CA4P22748 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CA4P22748 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CA4P22748 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CA4P22748 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CA4P22748 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CA4P22748 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms