Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms