Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms