Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms