Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLK3P07288 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLK3P07288 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLK3P07288 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms