Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 BCAS2P3-201ENST00000416374 767 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AP001528.1-201ENST00000499504 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms