Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3AO14802 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms