Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms