Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms